Kard. Tagle jest pierwszym przełożonym watykańskiej dykasterii, który uzyskał pozytywny wynik testu COVID-19. Kiedy w marcu wybuchła we Włoszech epidemia koronawirusa wynik pozytywny uzyskał wikariusz Ojca Świętego dla diecezji rzymskiej, kardynał Angelo De Donatis. Został hospitalizowany, ale od tego czasu wyzdrowiał i wznowił normalną działalność.

„Tak, potwierdzam, że kardynał Tagle obecnie uzyskał pozytywny wynik testu na Covid-19 poprzez wymaz z gardła, przeprowadzony wczoraj po jego przybyciu do Manili”, potwierdził Matteo Bruni korespondentce agencji Zenit, Deborah Lubov, zauważając: „Jego Eminencja nie ma żadnych objawów i pozostanie w izolacji na Filipinach, gdzie obecnie przebywa”. Dodał, że 7 września, kard. Tagle przeszedł już wymaz w Rzymie, z wynikiem negatywnym.

Obecnie, jak zapewnił rzecznik Watykanu, „przeprowadzane są niezbędne kontrole są wśród osób, które zetknęły się z Jego Eminencją w minionych dniach". Ostatni raz kardynał Tagle spotkał się z papieżem Franciszkiem 29 sierpnia.